Laboratorijske metode u fitopatologiji
Opterećenje: P15+L15+0
Sadržaj predmeta: Predavanja:
1. Osnove i značaj laboratorijskih metoda u fitopatologiji.
2. Terensko sakupljanje uzoraka sa oboljelih stabala. Priprema i analiza uzoraka. Priprema hranjivih medija za izolaciju i uzgoj patogenih gljiva, priprema uzoraka organa i/ili tkiva; postupci dobivanja i uzgoja čistih kultura patogenih gljiva; metode sporulacije.
3. Analize izoliranih kultura patogenih gljiva pod stereolupom te svjetlosnim mikroskopom. Donošenje zajključaka o rezultatima provedene izolacije, identifikacije i inokulacije, odnosno zaključka o uzroku određene patološke pojave/bolesti.
4. Postupci inokulacije i poštivanje Koch-ovih postulata u svrhu potvrđivanja patogenosti izoloranih gljiva.
5. Donošenje zajključaka o rezultatima provedene izolacije, identifikacije i inokulacije, odnosno zaključka o uzroku određene patološke pojave/bolesti.
Vježbe:
1. Priprema i analiza uzoraka organa i/ili tkiva pod stereolupom te svjetlosnim mikroskopom.
2. Terensko sakupljanje uzoraka sa oboljelih stabala, priprema uzoraka organa i/ili tkiva za postupak izolacije patogena iz oboljelih stanica/tkiva.
3. Priprema hranjivih medija za izolaciju i uzgoj patogenih gljiva; priprema uzoraka organa i/ili tkiva za postupak izolacije patogena iz oboljelih stanica/tkiva; postupci dobivanja i uzgoja čistih kultura patogenih gljiva; metode sporulacije.
4. Postupak ekstrakcije stanične DNA izoliranog patogena i umnožavanja ciljanih sekvenci PCR metodom; analiza rezultata elektroforezom na agaroznom gelu i sekvenciranje.
Literatura:
Obvezna literatura:
1. Johnston, A. & C. Booth, 1983: Plant Pathologist Pocketbook. Second Edition. CAB, Kew, Surrey, 439 st
Dopunska literatura
1.Strouts, R.G. & Winter, T.G., 1994: Diagnosis of ill-health in trees. HMSO, London, 307 str.
2.Diminić, D., Kajba, D. & Bezjak, J., 2002: Gljive uzročnici hipertrofija i rak-rana na topolama u klonskom arhivu "Podturen". Rad. Šumar. inst. 37(2): 169–183.
3.Diminić, D., van Dam, B. C. & Hrašovec, B., 2004: Sphaeropsis sapinea: The Cultural Characteristics of Isolates in Relation to Various Impacts on Pines in Croatia. Acta Phytopathologica et Entomologica